- Ramzi Binalshibh, een Jemenitische man die door de Amerikaanse aanklagers wordt omschreven als de coördinator van de aanslagen van 11 september. Hij zou, volgens Amerikaanse inlichtingendiensten, eigenlijk een van de kapers zijn, maar hij kon geen visum voor de VS krijgen.
- Mustafa Ahmad al-Hawsawi, een man uit Saoedi-Arabië die de Amerikaanse inlichtingendienst omschrijft als een van de twee belangrijkste financiers van de aanslagen.
- Ali Abd al-Aziz Ali, die ervan wordt beschuldigd een belangrijke luitenant te zijn van Khalid Sheik Mohammed – zijn oom – tijdens de voorbereidingen van de aanslagen.
- Walid Bin Attash, een man uit Jemen die volgens het Pentagon heeft toegegeven dat hij het brein was achter de aanslag op het Amerikaanse vliegdekschip USS Cole voor de kust van Jemen in 2000. Ook wordt hij beschuldigd betrokkenheid bij de aanslagen van 11 september.
De vijf verdachten worden beschuldigd van terrorisme en 2.973 aanklachten van moord. Khalid Sheikh Mohammed heeft bekend dat hij de aanslagen in 2001 „van A tot Z” heeft gepland. De militaire aanklagers zullen de doodstraf tegen de verdachten eisen.
Wanneer het proces echt van start gaat, is nog onduidelijk. De officier van justitie wil dat het proces begint op 15 september. Volgens de advocaten van de vijf verdachten is deze datum bewust gekozen om de Amerikaanse verkiezingscampagne te beïnvloeden.